MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3

Total Repeats: 1390

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009928	AAC	2	6	58	63	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009928	AGA	2	6	197	202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009928	TAC	2	6	244	249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009928	TGC	2	6	280	285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009928	ATC	2	6	1314	1319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009928	AGC	2	6	1321	1326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009928	AG	3	6	1391	1396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009928	TGCG	2	8	1445	1452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009928	ACA	2	6	2336	2341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009928	CAG	2	6	2363	2368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009928	CTT	2	6	2381	2386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009928	TTGG	2	8	2433	2440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009928	TGC	2	6	2474	2479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009928	GCA	2	6	2539	2544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009928	ATT	2	6	2568	2573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009928	TGC	2	6	2575	2580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009928	GGC	2	6	2624	2629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009928	ACACT	2	10	2630	2639	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_009928	TCC	2	6	3138	3143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_009928	CCA	2	6	3155	3160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_009928	TTC	2	6	3196	3201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009928	GGAG	2	8	3273	3280	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009928	AT	3	6	3658	3663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009928	GAA	2	6	3853	3858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009928	CTTAA	2	10	4000	4009	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009928	AGA	2	6	4847	4852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009928	GGCAGG	2	12	5230	5241	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009928	TGG	2	6	5252	5257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009928	AGC	2	6	5615	5620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009928	CAG	2	6	5723	5728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009928	TTAG	2	8	5740	5747	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009928	TA	3	6	5825	5830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009928	ATTT	2	8	5837	5844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009928	AGCTA	2	10	5870	5879	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009928	TGA	2	6	6201	6206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009928	AC	3	6	6246	6251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009928	AGAA	2	8	6288	6295	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009928	GAAA	2	8	6317	6324	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009928	T	7	7	6332	6338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009928	AGG	2	6	6505	6510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009928	A	6	6	6538	6543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009928	T	6	6	6708	6713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009928	AGGC	2	8	6838	6845	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009928	AT	3	6	10345	10350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009928	GAAT	2	8	10395	10402	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009928	TTA	2	6	10408	10413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009928	GCT	2	6	10443	10448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009928	TTG	2	6	10470	10475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009928	TCAG	2	8	10482	10489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009928	CAA	2	6	10516	10521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009928	A	7	7	10556	10562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009928	ATT	2	6	10577	10582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009928	TTTG	2	8	12676	12683	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009928	GT	3	6	12704	12709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009928	C	6	6	12806	12811	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_009928	TCCA	2	8	12929	12936	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009928	TC	3	6	12998	13003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009928	TCT	2	6	14277	14282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009928	TAGA	2	8	14394	14401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009928	ATT	2	6	14405	14410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009928	TCA	2	6	16423	16428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009928	TA	3	6	16483	16488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009928	ATC	2	6	16593	16598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009928	TGTGG	2	10	16625	16634	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009928	ACT	2	6	16642	16647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009928	AAT	2	6	16657	16662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009928	CT	3	6	16668	16673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009928	TTTG	2	8	16707	16714	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009928	GTAT	2	8	16785	16792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009928	CGT	2	6	21655	21660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009928	AGCTT	2	10	21663	21672	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_009928	AGT	2	6	21674	21679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009928	ATG	2	6	21713	21718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009928	A	7	7	22248	22254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009928	TG	3	6	22269	22274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009928	GCT	2	6	22281	22286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009928	TGG	2	6	22461	22466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009928	TAT	2	6	22483	22488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009928	CAA	2	6	22501	22506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009928	TTGG	2	8	22512	22519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009928	TGT	2	6	22948	22953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009928	GAA	2	6	22964	22969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009928	CAGA	2	8	22973	22980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009928	CAAGGT	2	12	23021	23032	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_009928	AAAT	2	8	23072	23079	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009928	ACA	2	6	23083	23088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009928	ACA	2	6	23115	23120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009928	GTT	2	6	23126	23131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009928	AAT	2	6	23139	23144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009928	TA	3	6	23195	23200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009928	TAAA	2	8	23203	23210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009928	AT	4	8	23213	23220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009928	T	6	6	23236	23241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009928	T	6	6	23271	23276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009928	ATA	2	6	23313	23318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009928	ATAA	2	8	23396	23403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009928	CTG	2	6	26636	26641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009928	AG	3	6	26642	26647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009928	A	6	6	26690	26695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009928	TGT	2	6	27079	27084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009928	AAT	2	6	28363	28368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009928	CAG	2	6	28440	28445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009928	GAA	2	6	28513	28518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009928	GAG	2	6	28521	28526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009928	CTG	2	6	28668	28673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009928	GAG	2	6	28699	28704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009928	CCT	2	6	28712	28717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_009928	TAA	2	6	28812	28817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009928	CT	3	6	28851	28856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009928	ACC	2	6	28912	28917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_009928	TTC	2	6	28942	28947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009928	AAG	2	6	29003	29008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009928	TAGG	2	8	29124	29131	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009928	TGA	2	6	29205	29210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009928	CTT	2	6	29211	29216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009928	TGC	2	6	29273	29278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009928	CGA	2	6	29301	29306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009928	TCT	2	6	29352	29357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009928	CAT	2	6	29577	29582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009928	CTT	2	6	29631	29636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009928	TGC	2	6	29756	29761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009928	AGG	2	6	29851	29856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009928	GGT	2	6	29884	29889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009928	TGC	3	9	29984	29992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009928	AGGG	2	8	30020	30027	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009928	AATG	2	8	30090	30097	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009928	TGAT	2	8	30166	30173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009928	CAA	2	6	30189	30194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009928	TCC	2	6	38122	38127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_009928	CCT	2	6	40819	40824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_009928	TCC	2	6	41020	41025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_009928	GTGG	2	8	41039	41046	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009928	ATT	2	6	42891	42896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009928	CAGG	2	8	42914	42921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009928	GTA	2	6	43002	43007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009928	A	7	7	43024	43030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009928	ATGAA	2	10	43258	43267	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009928	GAC	2	6	43288	43293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009928	ATA	2	6	43327	43332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009928	GTG	2	6	47085	47090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009928	TAA	2	6	47122	47127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009928	CCT	2	6	47185	47190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_009928	GATC	2	8	47231	47238	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_009928	AT	3	6	47301	47306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009928	GA	3	6	47345	47350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009928	ATG	2	6	47384	47389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009928	AAG	2	6	47428	47433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_009928	TGA	2	6	102212	102217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_009928	TCG	2	6	102496	102501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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